Ecole Supérieure des Techniques de Biologie Appliquée

INSTITUT CURIE – Poste d’Assistant(e) Ingénieur(e) / Ingénieur(e) d’études

Poste d’Assistant(e) Ingénieur(e) / Ingénieur(e) d’études au sein de la plateforme

ICGex de séquençage haut débit (NGS)

Affectation: Plateforme ICGex – Séquençage haut débit (NGS)

Institut Curie – Centre de Recherche de Paris

Disponibilité: 15 novembre 2018

Type de contrat: COD – durée 18 mois

Contexte:

L’Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d’un hôpital et d’un centre de

recherche (1000 personnes environ). L’objectif du Centre de Recherche de l’institut Curie est de développer la

recherche fondamentale et d’utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la

thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service

du malade.

Activité:

La plateforme de séquençage haut débit de l’institut Curie a pour mission de permettre aux équipes de recherche

de bénéficier des avancées considérables en génomique permises gâce l’avénement des technologies de

séquençage de nouvelle génération. La plateforme se veut flexible et versatile afin de pouvoir répondre au mieux

aux besoins des chercheurs. Le parc technologique est composé de séquenceurs Illumina de très haut débit

(NovaSeq 6000 et HiSeq 2500) et moyenne débit (MiSeq) ainsi qu’un séquenceur long reads PacBio (Sequel).

Les applications couvertes sont très diversifiées autour de 3 axes que sont la génomique (WGS, WES, Targetedseq),

la transcriptomique (RNAseq) et l’épigénétique (ChiPseq, WGBS, Chhromatine Conformation Capture). Des

développements en génomique sur cellules uniques sont en cours (Chromium system).

Missions:

Sous l’autorité du Responsable de la plateforme, l’assistant(e) ingénieur(e) / ingénieur(e) d’études devra :

– Participer à l’interface entre la plateforme et les porteurs de projets (réunions pré-run et suivi de projet)

– Prendre en charge les projets de séquençage : contrôle qualité des échantillons, préparation des banques et

séquençage sur les différentes plateformes (Illumina et Sequel)

– Participer à la veille technologique et l’évolution des protocoles utilisés en routine au laboratoire

– Participer à l’entretien des appareils et au bon fonctionnement du laboratoire

Connaissances:

Maîtrise des techniques de bases en biologie moléculaire et en séquençage haut débit (contrôle qualité

ADN/ARN, préparation de banques, DNAseq, RNAseq, ChIPseq …).

Profil recherché:

Curieux et rigoureux, doté d’excellentes capacités relationnelles mais aussi de capacités d’adaptation et

d’autonomie, vous justifiez d’une formation Bac+3/+5 en biologie moléculaire et génomique. La capacité à

travailler en équipe est indispensable et la maîtrise de l’anglais souhaitée. Avoir de 3 à 5 ans d’expérience dans

le domaine constituerait un plus.

 

Contact: pour obtenir des précisions sur cette offre et les coordonnées de la personne en charge de cette offre, envoyez un email à cathy.guilbot@estba.org , en précisant vos nom et prénom ainsi que le nom et l’année de la formation que vous avez suivie à l’ESTBA.