A la demande des entreprises, la décision d'ouverture des sections en contrat de qualification fut prise en juillet 1988.
Les sections ouvertes en contrat de qualification étaient : - Hygiène de la production et contrôle de qualité des produits Agro-Alimentaires
- Microbiologie Industrielle
- Bioexpérimentation Industrielle
- Technico-Commercial en instrumentation et réactifs de laboratoire
- Maintenance et Service Après-Vente de l'instrumentation de laboratoire
Evolution du nombre de contrats de qualification
Octobre 1988 23 contrats financés par 2 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1989 80 contrats financés par 8 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1990 96 contrats financés par 8 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1991 98 contrats financés par 6 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1992 99 contrats financés par 8 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1993 93 contrats financés par 12 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1994 103 contrats financés par 10 Organismes Mutualisateurs Agréés
Octobre 1995 98 contrats financés par 9 Organismes Paritaires Collecteurs Agréés
A partir d'octobre 1996, les contrats de qualification sont progressivement remplacés par des contrats d'apprentissage.
Octobre 1996 12 contrats financés par 3 Organismes Paritaires Collecteurs Agréés.
Octobre 1997 3 contrats financés par 1 Organisme Paritaire Collecteur Agréé
De 1988 à 1997, l'ESTBA a formé 705 jeunes par la voie de l'alternance sous le statut Contrat de Qualification